Située dans la vallée de l’Hers, au sein d’une région calcaire, Fontestorbes est une exurgence d’une partie des eaux du plateau de Sault qui s’étend à cheval sur les départements de l’Ariège et de l’Aude.

En période d’étiage, le phénomène est spectaculaire : en 40 minutes, on passe d’un débit maximum de 1.8 m3/s à un écoulement presque nul.
On revient ensuite au maximum des eaux en 21 minutes, en moyenne.
Ce phénonème est surtout visible entre juillet et décembre.

Durant les périodes de basses eaux, le débit continue grâce aux réserves noyées de la fontaine qui sont d’environ 30 millions de m3.
En fait, les variations d’écoulement dépendent du débit d’alimentation de la source.
Il s’agit d’un réservoir vidangé par une galerie sur laquelle débouche un second conduit de prise d’air, lui-même en relation avec le réservoir, et dont les deux extrémités sont situées au même niveau.
Ces deux extrémités étant sur le même plan, il n’existe entre elles aucune pression.

En revanche, lors du passage dans la galerie de vidange se crée une dépression qui va aspirer l’air.
Ainsi, dès que le débit de vidange est supérieur au débit de remplissage, le niveau baisse dans le réservoir.
La prise d’air qui s’effectue alors introduit celui-ci par inspiration, dans la conduite de vidange.
L’intrusion de cet air dans la galerie de vidange entraîne une diminution du débit, qui devient inférieur à celui du remplissage.
Le niveau remonte alors dans le réservoir, jusqu’à ce que la prise d’air disparaisse.
Le débit de vidange redevient ce qu’il était.

Ce phénomène unique n’a pu exister que par hasard ; la source a rencontré une roche plus dure.
Elle l’a contournée et les deux galeries se sont rejointes au même niveau.
A environ 1 km au sud-est, entre Fontestorbes et l’intermittence, se trouve le gouffre de Caoujous qu’on soupçonne de jouer le rôle d’appel d’air.
Il est constitué d’une succession de puits conduisant à une galerie dont chaque extrémité débouche sur un plan d’eau.